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目的基因的擴(kuò)增:PCR原理與過程

一、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的基本過程

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是通過PCR儀,模擬DNA半保留復(fù)制,從而體外快速擴(kuò)增DNA的方式。

生物實(shí)驗(yàn)室要用到PCR的地方……簡直數(shù)不勝數(shù)。比如擴(kuò)基因、檢測、吃螺師粉兒(什么鬼……)等等。

典型的PCR包括高溫變性、低溫退火、中溫延伸三個步驟,通過將這一套過程不斷循環(huán),使DNA得以成百萬倍的擴(kuò)增。

當(dāng)然這是典型的……不典型的PCR五花八門。

因此所謂的PCR儀,其實(shí)就是一套自動溫控系統(tǒng),早先人們做PCR都是用水浴鍋來做,指甲蓋大小的離心管,在三個鍋?zhàn)永飦砘氐箒淼谷?,拼個手速,攢個人品,好不熱鬧。

這么想想,其實(shí)現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)室還是蠻幸福的。

高溫變性:所謂變性是95℃左右時DNA雙鏈打開的過程,使之能夠與引物結(jié)合,為下面的反應(yīng)做準(zhǔn)備。但是注意考點(diǎn):這里的DNA不只是我們加進(jìn)去的模板DNA,還包括擴(kuò)增出來的DNA,體系里但凡是雙鏈,高溫都能給他打開了。這個過程大約需要5 min左右,再長就煮熟了。

低溫退火:退火是個很親切的詞,這是我們做無機(jī)非金屬里面的概念,不知道是哪位巨巨給引入了生物學(xué)。所謂退火就是適宜條件下冷卻的過程,上面說到DNA高溫變性,變性后的單鏈與引物通過堿基互補(bǔ)配對,再次形成局部雙鏈。更準(zhǔn)確的來講應(yīng)該叫復(fù)性,恢復(fù)雙鏈的過程。

中溫延伸:模板-引物接頭之后,對你沒看錯,人家就叫接頭,濃濃的社會氣息。延伸就是在72℃、TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為原料,以靶向序列為模板,堿基互補(bǔ)配對為原則,再次合成完整的雙鏈DNA的過程。我們可以看到這里復(fù)制之后實(shí)際上有一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,另一條則是原先就存在的,因此說這叫半保留復(fù)制。

目的基因的擴(kuò)增:PCR原理與過程

二、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的組成成分

1.模板(1 ng/μL

模板DNA可以從各種生物組織中得到,通常濃度為1 ng/μL。濃度不是越高越好,濃度太高會導(dǎo)致大量的非特異性結(jié)合。

2.引物(10 μmol/L

引物濃度通常是10 μmol/L。

引物濃度太低,產(chǎn)量較低;

引物濃度太高,引起錯配、非特異性以及引物二聚體。

一般都是商用的合成好之后直接用就好。

聽說西雙版納植物園早先的時候訂個引物要花一個星期送到,也是十分艱苦了。

現(xiàn)在的公司一般次日達(dá),甚至當(dāng)天給你送到,絕不會耽誤你的畢業(yè)。

上海生工貌似快要一統(tǒng)江湖了,給金維智打一波廣告……

3.Taq酶(5 U/μL

U是酶活力單位,定義為:25℃下(其它為最適條件),1分鐘內(nèi)能轉(zhuǎn)化1 μmol底物的酶含量,或是轉(zhuǎn)化底物中1 μmol有關(guān)基團(tuán)的酶含量。

4.dNTP2.5 mmol/L

dNTP可與Mg2+結(jié)合,使游離的Mg2+濃度下降,從而影響DNA聚合酶的活性。

5.Buffer(含Mg2+

Mg2+DNA聚合酶的激活劑。

Mg2+濃度過低會使DNA聚合酶活性降低,PCR產(chǎn)量下降。

Mg2+濃度過高會使特異性降低。

三、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的體系

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的體系

四、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的結(jié)果

瓊脂糖凝膠電泳檢測以大腸桿菌堿性磷酸酶(AKP)為例,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果如下。

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的結(jié)果

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