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用細(xì)菌群落制作復(fù)雜的圖像

用細(xì)菌群落制作復(fù)雜的圖像

利用光和基因工程細(xì)菌,斯坦福大學(xué)的研究人員能夠塑造細(xì)菌群落的生長(zhǎng)。從波爾卡圓點(diǎn)到條紋到電路,它們可以在一夜之間呈現(xiàn)錯(cuò)綜復(fù)雜的設(shè)計(jì)。該技術(shù)在319日在美國(guó)國(guó)家科學(xué)院的會(huì)議記錄中描述,可以實(shí)現(xiàn)以25微米的分辨率生長(zhǎng)的生物膜,其大約是一粒食鹽的大小的四分之一。

生物工程學(xué)助理教授Ingmar Riedel-Kruse說:地球上的大多數(shù)細(xì)菌都生活在生物膜群落中,而生物膜在健康疾病中非常重要 - 例如我們牙齒上的菌斑或?qū)Ч芗?xì)菌感染。該文件。了解生物膜的功能如何在許多層面上是一個(gè)重要問題。

該組織表示,該技術(shù)可以闡明生物膜如何生長(zhǎng)并導(dǎo)致新型生物材料或合成微生物群落的開發(fā),這些新型生物材料或微生物群落可用于小型設(shè)備或系統(tǒng),如微流控芯片或基于生物膜的電路。

生物膜光刻

該小組的技術(shù)依賴于他們基因工程的大腸桿菌細(xì)菌分泌粘性蛋白質(zhì)以響應(yīng)特定波長(zhǎng)的藍(lán)光。當(dāng)他們將適當(dāng)波長(zhǎng)的光照射在修飾細(xì)菌培養(yǎng)皿上的所需圖案上時(shí),細(xì)菌粘附在光照區(qū)域,形成圖案形狀的生物膜。研究人員稱他們的技術(shù)生物膜光刻與制造電子電路中使用的光刻相似。

存在其他圖案化細(xì)菌群落的技術(shù),包括用噴墨打印機(jī)沉積它們,或者用在特定區(qū)域中偏向細(xì)菌生長(zhǎng)的化學(xué)物質(zhì)預(yù)先形成培養(yǎng)表面圖案。然而,生物膜光刻具有速度快,簡(jiǎn)單,分辨率高以及與各種表面環(huán)境(包括封閉的微流體裝置)兼容的優(yōu)點(diǎn),研究人員說。

使用生物膜光刻技術(shù)進(jìn)行復(fù)雜的設(shè)計(jì)可能有助于探索細(xì)菌群落的動(dòng)態(tài)。

生物膜與其他細(xì)菌存在于一個(gè)社會(huì)環(huán)境中,生物工程研究生Xiaofan Jin說。他是該論文的主要作者。這些細(xì)菌之間的相互作用通常是由它們相對(duì)于彼此生長(zhǎng)的地方?jīng)Q定的,并且這可能是確切指定某些物種能夠在何時(shí)何地存活于細(xì)菌群體中的極好工具。

在測(cè)試生物膜光刻技術(shù)時(shí),研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的見解。他們認(rèn)為細(xì)胞在照明區(qū)域內(nèi)外游動(dòng)會(huì)產(chǎn)生模糊的圖案,但設(shè)計(jì)出奇地尖銳。這些清晰的圖像使得該小組得出結(jié)論,許多細(xì)菌必須已經(jīng)弱結(jié)合到培養(yǎng)表面上。而不是巡視盤子,看起來細(xì)菌不斷地在表面上跳躍和跳躍。

Riedel-Kruse解釋說:在文獻(xiàn)中,關(guān)于某些細(xì)菌物種如何形成生物膜有不同的模型。至少在這個(gè)物種中,我們認(rèn)為我們?yōu)檫@一假設(shè)提供了額外的證據(jù)。

硅靈感

巧合的是,研究人員用生物膜獲得的25微米分辨率與第一種硅光刻法類似,這促成了硅半導(dǎo)體的廣泛成功。同樣,研究人員看到了許多多功能和有影響力的細(xì)菌設(shè)計(jì)應(yīng)用。

我們希望這個(gè)工具可以用于進(jìn)一步了解天然和合成細(xì)菌群落,Jin說。我們也看到了讓這些社區(qū)做有用的事情的潛力,如代謝生物合成或分布式生物計(jì)算。甚至有可能創(chuàng)造新型生物材料,如導(dǎo)電生物膜電路。

研究人員目前正在采取措施,通過生物膜光刻技術(shù)同時(shí)生長(zhǎng)多種細(xì)菌菌株,以形成多種群落。特別是,他們希望了解生物膜中的細(xì)菌如何共享抗生素抗性 - 這是一個(gè)具有重大臨床意義的問題,因?yàn)樯锬ひ灶B固抗生素治療而聞名。