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微流控到底如何用于菌群研究

微流控生物芯片

Biomicrofluidics:菌群研究中可用的微流控技術(shù)(綜述)

① 微流控技術(shù)通過(guò)微流控芯片和細(xì)胞捕獲實(shí)現(xiàn)對(duì)微生物單個(gè)細(xì)胞的追蹤觀察,是微生物研究中的新方法;

② 現(xiàn)有的微流控(芯片)裝置可以分為連續(xù)流動(dòng)裝置、微液滴裝置、(試)紙裝置和數(shù)字微流控裝置等四類;

③ 使用流體陷阱、微孔播種、電勢(shì)陷阱、微液滴包裝和光學(xué)陷阱等方法捕獲單細(xì)胞,從而在單細(xì)胞層面實(shí)現(xiàn)追蹤和持續(xù)監(jiān)測(cè);

④ 結(jié)合微流控可以實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞水平上的基因測(cè)序、表達(dá)譜分析、代謝分析和疾病篩查等,具有十分光明的應(yīng)用前景。

Microfluidics: A new tool for microbial single cell analyses in human microbiome studies

2017-12-13  DOI: 10.1063/1.5002681

氯胺酮的抗抑郁效果或與腸-腦軸相關(guān)

TP:氯胺酮的抗抑郁效果或與腸-腦軸相關(guān)

① 2000年,Berman等報(bào)道一定劑量氯胺酮可以起到抗抑郁效果,但其也有令病人產(chǎn)生幻覺(jué)等副作用;

② 氯胺酮包含有R型和S型,比較兩種化合物對(duì)社交失敗壓力(CSDS)模型小鼠腸道菌群的影響及抗抑郁效果;

③ CSDS小鼠的柔膜菌門(mén)及放線菌門(mén)的水平發(fā)生變化;

④ 兩種氯胺酮可抑制CSDS小鼠δ變形菌綱的增長(zhǎng),但僅有R型可顯著抑制柔膜菌綱的減少;

⑤ 這可以解釋為什么R型氯胺酮抗抑郁效果更好,且副作用小。

Possible role of the gut microbiota-brain axis in the antidepressant effects of (R)-ketamine in a social defeat stress model

2017-12-18  DOI: 10.1038/s41398-017-0031-4

腸道活潑瘤胃球菌如何識(shí)別唾液酸

NC:腸道活潑瘤胃球菌如何識(shí)別唾液酸?

① 活潑瘤胃球菌是典型的人體腸道共生菌,利用反式唾液酸酶降解黏液蛋白,該酶具有唾液酸特異的糖結(jié)合蛋白(RgCBM40);

② RgCBM40有CBM40蛋白亞家族典型的β-三明治夾層結(jié)構(gòu),特異結(jié)合α2,3或α2,6-唾液酸乳糖苷,特異性識(shí)別具有廣譜性;

③ RgCBM40可與杯狀細(xì)胞分泌的粘液以及純化的黏液蛋白結(jié)合,可視為新的黏附素,其結(jié)構(gòu)廣泛分布于厚壁菌門(mén);

④ 活潑瘤胃球菌以唾液酸為媒介,與腸粘液結(jié)合;

⑤ 為研究共生菌在腸道定殖與分布提供了新信息。

Unravelling the specificity and mechanism of sialic acid recognition by the gut symbiont Ruminococcus gnavus

2017-12-19  DOI: 10.1038/s41467-017-02109-8

設(shè)計(jì)PPI治療方案,多考慮點(diǎn)

Gut:設(shè)計(jì)PPI治療方案,多考慮點(diǎn)

① 幽門(mén)螺旋桿菌陽(yáng)性患者長(zhǎng)期接受質(zhì)子泵抑制劑(PPI)治療會(huì)促進(jìn)特殊腺體流失而導(dǎo)致萎縮性胃炎,故建議先根除幽門(mén)螺桿菌;

② 153(0.24%)名進(jìn)行幽門(mén)螺旋桿菌根除治療后的患者,在PPI治療后,中位7.6年間患上胃癌;

③ PPI治療設(shè)計(jì)時(shí),要考慮患者初始胃部狀況如萎縮性胃炎和腸上皮化生等,以及不同PPI(如奧美拉唑、雷貝拉唑、蘭索拉唑等)在抑酸強(qiáng)度上的差異,強(qiáng)烈抑酸作用使萎縮性胃炎惡化;

④ 還應(yīng)考慮飲食習(xí)慣和癌癥家族史等其他危險(xiǎn)因素。

Several aspects in study design need further consideration

2017-12-19  DOI: 10.1136/gutjnl-2017-315692

體外利用糞菌發(fā)酵不同益生元

Nutrients:體外利用糞菌發(fā)酵不同益生元

① 在糞便菌群體外發(fā)酵系統(tǒng)中,比較5種常見(jiàn)膳食纖維(β-葡聚糖、商業(yè)化β-葡聚糖Oatwell、低聚木糖、菊粉、包含菊粉/果膠/纖維素/半纖維素的商品化益生元WholeFiber)的益生元效應(yīng);

② 發(fā)酵12h后,OatWell產(chǎn)生最多的丙酸鹽,與β-葡聚糖的效應(yīng)相似;

③ 發(fā)酵24h后,低聚木糖顯著增加雙歧桿菌屬;

④ 菊粉及WholeFiber可增加有益菌屬Collinsella,與之前的臨床研究結(jié)果一致;⑤ 所有益生元均可促進(jìn)有益短鏈脂肪酸的形成。

Prebiotic Dietary Fiber and Gut Health: Comparing the in Vitro Fermentations of Beta-Glucan, Inulin and Xylooligosaccharide

2017-12-15  DOI: 10.3390/nu9121361

苦瓜調(diào)節(jié)肥胖大鼠腸道菌群并改善代謝

JFF:苦瓜調(diào)節(jié)肥胖大鼠腸道菌群并改善代謝

① 苦瓜富含膳食纖維和其他生物活性化合物,給肥胖大鼠喂食高脂飲食(HFD)并用苦瓜粉(BMP)處理8周;

② HFD組相比,BMP有效延緩體重增加和提高胰島素敏感性,降低內(nèi)毒素負(fù)荷;

③ BMP改變了腸道菌群,尤其是勞特氏菌屬和Allobaculum屬的豐度,也改變了代謝譜,包括有機(jī)酸、氨基酸和糖類的代謝;

④ 屬水平的特定腸道菌群與有效生物標(biāo)志物之間有顯著的相關(guān)性;

⑤ 在肥胖小鼠中,BMP通過(guò)恢復(fù)腸道菌群和腸道代謝產(chǎn)物發(fā)揮抑制胰島素抵抗和抗炎作用。

Modulation of gut microbiota and gut-generated metabolites by bitter melon results in improvement in the metabolic status in high fat diet-induced obese rats

2017-12-22  DOI: 10.1016/j.jff.2017.12.050

飼料中添加中藥可顯著改善銀鯽的腸道菌群

JAM:飼料中添加中藥可顯著改善銀鯽的腸道菌群

① 研究具有抗炎和免疫活性的玉屏風(fēng)散(防風(fēng)、黃芪和白術(shù))作為中藥飼料添加劑對(duì)異育銀鯽腸道菌群的影響;

② 中藥可增加異育銀鯽的菌群豐度、多樣性以及均勻性,在門(mén)水平上,變形桿菌門(mén)、放線菌門(mén)、 酸桿菌門(mén)數(shù)量顯著增加,梭桿菌門(mén)數(shù)量顯著降低;

③ 在屬水平上,潛在的病原體如發(fā)病氣單胞菌、 鮑曼不動(dòng)桿菌和希瓦氏菌水平降低,潛在的益生菌如乳桿菌、 乳酸乳球菌、芽孢桿菌和假單胞菌水平升高;④ 為中藥在水產(chǎn)養(yǎng)殖方面應(yīng)用提供依據(jù)。

Significant improvement of intestinal microbiota of gibel carp (Carassius auratus gibelio) after traditional Chinese medicine feeding

2017-12-18  DOI: 10.1111/jam.13674

虹鱒魚(yú)吃點(diǎn)大蒜,長(zhǎng)得塊菌群也顯獨(dú)特

Aquaculture:虹鱒魚(yú)吃點(diǎn)大蒜,長(zhǎng)得塊菌群也顯獨(dú)特

① 240條健康虹鱒魚(yú)分為4組,分別在飼料中添加0、1%、1.5%、2%的大蒜提取物,持續(xù)120天;

② 相比于對(duì)照組,補(bǔ)充了大蒜的虹鱒魚(yú)的體重增加及比生長(zhǎng)速率顯著升高;

③ 對(duì)腸黏膜菌群進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),對(duì)照組虹鱒魚(yú)中豐度最高的是Deefgea菌屬及氣單胞菌屬;

④ 飼料中大蒜含量為1%及1.5%的虹鱒魚(yú)中,腸道菌群豐度最高的是Deefgea菌屬及支原體屬;

⑤ 飼料中大蒜含量為2%的虹鱒魚(yú)中,腸道菌群豐度最高的是氣單胞菌屬。

Effects of garlic-supplemented diet on growth performance and intestinal microbiota of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

2017-12-17  DOI: 10.1016/j.aquaculture.2017.12.022

微流控到底如何用于菌群研究

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